截至6月26日9时统计，新疆维吾尔自治区吐鲁番市托克逊县发生的5.4级地震造成新疆、兵团少量房屋不同程度损坏。具体灾情如下：

据新疆维吾尔自治区民政厅报告，吐鲁番市托克逊县、巴音郭楞蒙古自治州和硕县500余人受灾，500余人需紧急生活救助；100余间房屋不同程度损坏；直接经济损失300余万元。

据新疆生产建设兵团民政局报告，二师24团1200余人受灾，600间房屋不同程度损坏，直接经济损失400余万元。