农村环境污染物的主要来源有以下四个方面：

一是人畜粪便、污水等，内含大量病原体，包括细菌、病毒、寄生虫卵等，是传播疾病的主要来源。

二是居室内燃煤不充分导致室内大量二氧化碳、芳烃、一氧化碳、氟化物等聚集，形成室内空气污染，引发呼吸系统疾病。

三是农药、化肥的不科学施用。不科学地施用农药以及防护措施不严格，可使有机氟、有机磷、有机氯、氨基甲酸醋、拟除虫菊酯类农药等有效成分，通过皮肤、口鼻黏膜等直接进入人体，造成毒害；对土壤和水体也会造成直接的污染。滥施化肥会导致养分流失，引起水体污染，严重破坏水体功能，严重的情况下，会导致鱼虾死亡、水体黑臭，使土壤和水体的自净功能丧失。

四是农村地区工业污染，如土法炼汞、炼金、炼硫磺、造纸、印染、电镀、制造磷肥、制造水泥等，都会产生许多有毒的废弃物，其中往往含有汞、二氧化碳、有机物、氰化物、氟化物、粉尘等有毒有害成分，污染水、空气、食物，危害人的健康。